红霉素、阿奇霉素、磺胺嘧啶、大蒜素体外抗弓形虫作用的研究
作者:
许丽芳;杨秋林;曾桥;张愉快;肖建华;...
期刊:
右江民族医学院学报,2004年(02):157-160 ISSN:1001-5817
作者机构:
南华大学诊断学教研室;南华大学寄生虫学教研室;南华大学寄生虫学教研室 湖南衡阳421001
关键词:
弓形虫;阿奇霉素;红霉素;磺胺嘧啶;大蒜素
摘要:
目的 比较阿奇霉素、红霉素、磺胺嘧啶、大蒜素体外抗弓形虫的效果。方法 用弓形虫RH株速殖子感染培养的巨噬细胞 ,每一种药物根据预实验设立 2至 3个浓度 ,分别在速殖子侵入细胞前和侵入细胞后用不同浓度的药物处理 ,每隔 1h在倒置显微镜下观察细胞及弓形虫的形态及生长情况 ,9d后取出盖玻片 ,染色透明后 ,镜下观察。再将培养液及培养细胞注入鼠腹腔 ,观察小鼠的发病情况。结果 阿奇霉素的浓度在 2 0 μg/ml时具有抑制虫体生长的作用 ,>40 μg/ml时对巨噬细胞有明显的毒性。红霉素的浓度在 10 0 μg/ml、15 0 μg/ml时可抑制弓形虫的生长与繁殖 ,但不能完全杀死虫体 ,形成假包囊。将假包囊及培养液接种小鼠腹腔 6d后小鼠发病死亡 ,解剖小鼠后 ,可见大量的虫体。没有观察到 10 0 μg/ml、2 0 0 μg/ml的磺胺嘧啶及 2 0 μg/ml、40 μg/ml的大蒜素有抑制弓形虫生长的作用。 结论 阿奇霉素具有明显杀灭速殖子的作用。低浓度的红霉素有利于包囊形成。磺胺嘧啶、大蒜素体外无杀灭速殖子的作用。
语种:
中文
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日本血吸虫钙调神经磷酸酶B基因的获得和分析
作者:
张愉快;肖建华;王可耕;刘传爱;曾桥;...
期刊:
中国人兽共患病学报,2004年20(5):410-412 ISSN:1002-2694
作者机构:
南华大学病原生物研究所,衡阳,421001;[万志刚; 杨秋林; 刘传爱; 王可耕; 曾桥; 杨胜; 肖建华; 张愉快] 南华大学
关键词:
日本血吸虫;cDNA文库;步移法;生物信息学;钙调神经磷酸酶B;基因
摘要:
目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum,Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新的蛋白基因,为日本血吸虫病的防治提供侯选疫苗和药物靶点.方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库,挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA,并进行生物信息学分析和登录.结果获得了1个日本血吸虫新基因-钙调神经磷酸酶(Calcineurin ,CaN)基因B(AY220751),长1266bp,编码169个氨基酸,含有2个"EF-hand"Ca+2结合区域,与曼氏血吸虫Calcineurin B有84%的同源性.结论步移法测序和生物信息学技术相结合有利于发现日本血吸虫新基因.
语种:
中文
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日本血吸虫7个基因全长cDNA的获取和分析
作者:
曾桥;肖建华;万志刚;张愉快;廖力;...
期刊:
中国人兽共患病学报,2004年20(12):1058-1061 ISSN:1002-2694
作者机构:
[曾桥; 肖建华; 万志刚; 张愉快; 廖力; 刘传爱; 杨秋林] 南华大学病原生物学研究所;南华大学病原生物学研究所 衡阳421001
关键词:
日本血吸虫;cDNA文库;基因;生物信息学
摘要:
目的从日本血吸虫成虫cDNA文库中分离、鉴定和分析全长cDNA序列,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点.方法从构建日本血吸虫成虫cDNA文库中挑取重组阳性克隆进行5'测序获取表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST),在此基础上进行引物延伸法(primer extension)测序,直至获取全长cDNA序列,将获取的基因登录GenBank,并进行生物信息学分析.结果获得7个日本血吸虫全长cDNA序列(GenBank登录号分别为AY336493~AY336499),其中6个为日本血吸虫新基因:类转录因子BTF3(similar to transcription factor BTF3)、延长因子1-α(elongation factor 1-alpha,EF1-α)、富含谷氨酰胺四联重复肽(small glutamine-rich tetratricopeptide,TRP)、鸟氨酸氨基转移酶(ornithine aminotransferase,OA)、内皮差异相关因子1(endothelial differentiation-related factor 1,EDF-1)和类基因转录增强因子(similar to testis enhanced gene transcript protein,TEGT);另1个是精氨酸酶(arginase)基因,比原发现的基因序列长456bp.生物信息学分析发现类基因转录增强因子为跨膜蛋白,具有6个跨膜区;各基因与人、鼠、蟾和曼氏血吸虫等物种的基因有37%~85%的同源性;蛋白结构和功能预测分析显示各基因分别含有NAC基元、精氨酸酶家族特征性序列、TEF基元、TRP基元、转氨酶基元、HTH-XRE基元和NAF位点,预示各基因分别具有相应的功能.结论 EST技术和引物延伸法有助于快速、经济地获取和研究日本血吸虫表达基因.
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中文
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日本血吸虫pcDNA3.1.(+)-SjPGK重组质粒的构建及鉴定
作者:
梁瑜;肖建华;刘传爱;廖力;伍和平;...
期刊:
实用预防医学,2004年11(6):1092-1094 ISSN:1006-3110
作者机构:
南华大学医学院寄生虫学教研室,湖南,衡阳,421001;[杨秋林; 刘传爱; 廖力; 伍和平; 张愉快; 肖建华; 梁瑜] 南华大学
关键词:
日本血吸虫;磷酸甘油酸激酶;基因克隆;序列测定
摘要:
目的构建日本血吸虫中国大陆株磷酸甘油酸激酶基因片段(SjPGK)的真核表达重组质粒,寻找新的预防日本血吸虫病的候选疫苗分子.方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,从日本血吸虫总RNA中体外扩增SjPGK基因片段;克隆入pMD18-T载体中,然后挑取阳性克隆经双酶切分析、PCR鉴定;亚克隆入真核表达载体pcDNA3.1(+)中,阳性克隆经鉴定后进行脱氧核糖核酸序列测定;运用Blast程序,将测序结果及其推导的编码氨基酸序列与NCBI数据库在核苷酸水平和氨基酸水平进行同源性比较. 结果RT-PCR特异性扩增出一条长约830 bp大小的条带;重组质粒pMD18-T-SjPGK和pcDNA3.1(+)-SjPGK经双酶切和以质粒为模板进行PCR扩增,均可获得一条与RT-PCR产物一致的DNA片段;脱氧核糖核酸序列测定和分析结果表明:SjPGK基因片段长为830 bp,与SmPGK的核苷酸同源性为85%,分值为672;氨基酸同源性为94%,分值为473. 结论成功地构建pcDNA3.1(+)-SjPGK重组质粒,为构建其核酸疫苗提供了条件.
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日本血吸虫表达序列标签和新基因的获取和分析
作者:
曾桥;肖建华;万志刚;张愉快;杨胜;...
期刊:
热带病与寄生虫学,2004年2(1):7-13 ISSN:1672-2302
作者机构:
南华大学病原生物学研究所,中国,湖南,衡阳,421001;[万志刚; 杨秋林; 刘传爱; 曾桥; 杨胜; 张愉快; 肖建华] 南华大学
关键词:
新基因;表达序列标签;成虫CDNA文库;生物信息学分析;日本血吸虫病;全长CDNA;药物靶点;侯选疫苗;EST技术;基因序列;方法筛选;阳性克隆;不同性别;步移法;同源性;生活史;测序
摘要:
目的分离、鉴定和分析日本血吸虫表达基因序列,为日本血吸虫病提供侯选疫苗分子和药物靶点.方法筛选日本血吸虫成虫cDNA文库,对重组阳性克隆进行测序以获取的EST;对可能成为新基金的克隆进行步移法测序获取全长cDNA,并进行生物信息学分析.结果共获得149个EST,分析发现某些EST与血吸虫的生活史的不同阶段和不同性别序列有一定的同源性.共获取18个日本血吸虫新基因,大部分为管家基因,其中部分基因可作为日本血吸虫的侯选疫苗分析和药物靶点.结论EST技术可用于快速、经济地发现日本血吸虫成虫新基因.
语种:
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日本血吸虫大陆株泛蛋白缀合酶E(SjUCEE)基因的A-T克隆
作者:
廖力;肖建华;刘彦;曾桥;万志刚;...
期刊:
中国血吸虫病防治杂志,2004年16(3):202-205 ISSN:1005-6661
作者机构:
南华大学病原生物学研究所;南华大学病原生物学研究所 衡阳421001
关键词:
日本血吸虫;泛蛋白缀合酶E基因;基因克隆
摘要:
目的日本血吸虫中国大陆株泛蛋白缀合酶E(ubiquitin-conjugating enzyme E ,SjUCEE)的基因克隆和鉴定.方法特定寡核苷酸引物PCR扩增目的基因;应用分子克隆常规操作方法将扩增产物克隆至载体puCm-T中.结果 PCR特异性扩增出SjUCEE编码区基因序列,其片段大小为757 bp;经酶切、PCR及测序鉴定表明所构建的质粒puCm-T/SjUCEE中含有所扩增的基因序列.结论 PCR扩增的SjUCEE抗原编码区基因序列与预期长度相符合,成功构建了含目的基因的原核质粒puCm-T/SjUCEE.
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日本血吸虫黏蛋白样蛋白部分基因的扩增及测序
作者:
刘彦;肖建华;廖力;曾谷清;张愉快;...
期刊:
中国寄生虫学与寄生虫病杂志,2004年22(3):167-169 ISSN:1000-7423
通讯作者:
Liu, Y.
作者机构:
[刘彦; 肖建华; 廖力; 曾谷清; 张愉快; 杨胜; 梁瑜] 南华大学基础医学院寄生虫学教研室;南华大学基础医学院寄生虫学教研室 衡阳421001
关键词:
日本血吸虫
摘要:
目的体外扩增日本血吸虫中国大陆株黏蛋白样蛋白(sjMLP)抗原的部分基因序列。 方法利用Pc- GENE软件查找SmMLP的抗原决定簇;特定寡核苷酸引物的设计与合成;Trizol抽提日本血吸虫成虫总RNA,逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增目的基因,测序后与SmMLP进行同源性分析。 结果 RT-PCR特异性扩增出siMLP编码区基因序列,其片段大小为756 bp,测序结果与SmMLP具有高度同源性。 结论RT-PCR扩增的sjMLP抗原编码区基因序列与预期相符合。
语种:
中文
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日本血吸虫pcDNA3.1(+)/MLP核酸疫苗对家兔的保护性免疫作用
作者:
刘彦;肖建华;廖力;曾谷清;张愉快;...
期刊:
中国血吸虫病防治杂志,2004年16(2):126-128 ISSN:1005-6661
作者机构:
南华大学病原生物学研究所,衡阳,421001;[王可耕; 廖力; 刘彦; 曾谷清; 张愉快; 肖建华] 南华大学
关键词:
日本血吸虫;核酸疫苗;免疫保护
摘要:
目的观察日本血吸虫pcDNA3.1(+)/MLP(SJP)核酸疫苗对家兔的保护性免疫作用.方法将24只新西兰家兔随机分为2组,每组12只;实验组每只家兔SJP的免疫剂量为500 μg/次,后腿肌肉注射,对照组注射空质粒pcDNA3.1(+);隔周免疫1次,共4次,最后1次免疫后2周进行日本血吸虫尾蚴攻击感染.尾蚴攻击感染60 d后处死,观察肝脏病变,计算减虫率及减卵率,并做血清抗体及细胞因子分析.结果 SJP免疫家兔可明显抑制肝脏虫卵肉芽肿的大小,肉芽肿数量减少,肝组织减卵率为28.10%,并可诱导IgA、IgG1变化,诱生INF-γ应答.结论 SJP免疫家兔对日本血吸虫尾蚴攻击感染可产生一定的保护作用.
语种:
中文
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日本血吸虫普遍性结合酶E基因的获得和分析
作者:
廖力;肖建华;刘彦;曾桥;万志刚;...
期刊:
中国血吸虫病防治杂志,2004年16(1):39-42 ISSN:1005-6661
作者机构:
湖南省南华大学病原生物学研究所,衡阳,421001;[万志刚; 刘彦; 廖力; 曾桥; 曾谷清; 肖建华] 南华大学
关键词:
日本血吸虫;cDNA文库;步移法;生物信息学;普遍性结合酶E;基因
摘要:
目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新基因,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点.方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA,登录GenBank,利用BLAST程序对同源性高的基因进行核苷酸和氨基酸水平的同源性比较;并利用pcgene软件对其蛋白质结构进行初步分析.结果获得了1个日本血吸虫新基因普遍性结合酶E基因(ubiqui-tin-conjugating enzyme E,AY251608),长854bp,编码149个氨基酸,与人类普遍性结合酶E具有55%的同源性,编码蛋白的理论分子量为7.149 8 kDa,等电点为8.01;抗原表位可能位于氨基酸序列373~396处.结论步移法测序和生物信息学技术相结合有利于发现日本血吸虫新基因.
语种:
中文
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运用生物信息技术分析日本血吸虫Z88基因cDNA序列
作者:
黄家芳;肖建华;曾桥;万志刚;张愉快;...
期刊:
寄生虫病与感染性疾病,2004年2(2):53-56 ISSN:1672-2116
作者机构:
湖南省衡阳市南华大学病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001;[万志刚; 胡永轩; 曾桥; 黄家芳; 张愉快; 肖建华] 南华大学
关键词:
日本血吸虫;cDNA序列;生物信息学;DnaJ-相似蛋白
摘要:
目的通过基因序列分析,寻找日本血吸虫新的基因,为日本血吸虫病防治筛选新的候选疫苗抗原.方法从已构建的日本血吸虫成虫cDNA文库中挑取已知克隆(克隆号为Z88),测定其全长cDNA序列后,再运用生物信息学方法以及相关软件对此基因进行分析.结果通过测定以及分析可知此基因的cDNA序列为1 303bp,编码349个氨基酸,为DnaJ-相似蛋白,与果蝇、鲐、人及鼠的DnaJ-相似蛋白有一定同源性.二级结构分析预测提示其具有一定抗原性.结论 Z88基因为日本血吸虫DnaJ-相似蛋白基因,可能参与蛋白折叠、装配和运输等功能.
语种:
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日本血吸虫核苷二磷酸激酶基因的获得和序列分析
作者:
张愉快;肖建华;梁瑜;曾桥;万志刚;...
期刊:
中南医学科学杂志,2004年32(1):13-16 ISSN:2095-1116
作者机构:
[万志刚; 廖力; 曾桥; 肖建华; 张愉快; 梁瑜] 南华大学
关键词:
日本血吸虫;二磷酸核苷激酶;cDNA文库;表达序列标签;步移法;生物信息学
摘要:
目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum, Sj)成虫cDNA文库中筛选日本血吸虫新基因,为日本血吸虫病的防治提供药物靶标或候选疫苗.方法筛选日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行DNA测序,再对新基因序列进行步移法测序获取全长cDNA,并利用生物信息学技术对其进行分析.结果获得了1个编码日本血吸虫核苷二磷酸激酶新基因的cDNA序列(AY226980),全长594 bp,编码157个氨基酸,编码蛋白与人类或鸽、鸡、鼠及果蝇的核苷二磷酸激酶高度同源.结论利用表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术三者相结合,成功获得了编码日本血吸虫核苷二磷酸激酶基因的cDNA序列.
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中文
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日本血吸虫PcDNA3.1(+)/MLP核酸疫苗的构建及其对家兔保护性免疫作用的研究
作者:
刘彦;肖建华;廖力;张愉快;曾谷清
期刊:
中国人兽共患病学报,2004年20(4):299-302,314 ISSN:1002-2694
作者机构:
[刘彦; 肖建华; 廖力; 张愉快; 曾谷清] 南华大学基础医学院寄生虫学教研室;南华大学基础医学院寄生虫学教研室 衡阳421001
关键词:
日本血吸虫;粘蛋白样蛋白基因;克隆;核酸疫苗
摘要:
目的体外扩增日本血吸虫中国大陆株粘蛋白样蛋白抗原的部分基因序列,构建日本血吸虫pcDNA3.1(+)/MLP核酸疫苗(SJP),免疫新西兰家兔,观察它在肌肉组织中的表达、及其对家兔的保护性免疫作用.方法分子克隆常规操作构建SJP疫苗,免疫家兔,家兔肌肉组织体外扩增查MLP基因,并通过免疫组化观察重组蛋白在局部肌组织中的表达;做血清抗体及细胞因子分析,计算减虫率及减卵率.结果经酶切、PCR及测序鉴定表明所构建的SJP中含有目的基因序列;免疫家兔8周后可以在免疫家兔肌肉中检测到MLP基因,免疫组化结果阳性;可诱导IgA、IgG1及INF-γ变化,减虫率为24.10%,减卵率为28.10%.结论成功地构建了含目的基因的核酸疫苗SJP,SJP免疫家兔后,肌组织有重组蛋白的表达,并可产生一定的免疫保护性作用.
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日本血吸虫肌动蛋白轻链基因的获得和分析
作者:
刘彦;肖建华;廖力;曾桥;张愉快;...
期刊:
中国人兽共患病学报,2004年20(11):960-962 ISSN:1002-2694
作者机构:
[刘彦; 肖建华; 廖力; 曾桥; 张愉快; 曾谷清] 南华大学原生物学研究所;南华大学原生物学研究所 衡阳421001
关键词:
日本血吸虫;表达序列标签;肌动蛋白轻链
摘要:
目的运用表达序列标签(expressed sequence tag,EST)技术,从日本血吸虫成虫cDNA文库中筛选和鉴定日本血吸虫新基因,为寻找日本血吸虫新的候选疫苗奠定基础.方法转化日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,获得EST;用NCBI站点的GenBank对所获得的新基因序列进行同源性检索;利用BLAST程序对同源性高的基因进行核苷酸和氨基酸水平的同源性比较;并利用pcgene软件对其蛋白质结构进行初步分析.结果发现xzw00081克隆的cDNA序列为日本血吸虫新基因并获得GenBank登录号(AY225851).该cDNA序列与曼氏血吸虫肌动蛋白轻链基因高度同源,核苷酸水平的同源性为84%;氨基酸水平的同源性为86%;编码蛋白的理论相对分子质量为10538.88,等电点为6.96;抗原表位可能位于氨基酸序列158~184处.结论用EST寻找日本血吸虫新基因是一种可行的方法,所筛选到的日本血吸虫新基因长374bp,编码88个氨基酸,与曼氏血吸虫肌动蛋白轻链基因高度同源,为进一步研究该基因的全序列及功能作准备.
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日本血吸虫SjPGK基因克隆和序列分析
作者:
梁瑜;肖建华;廖力;伍和平;张愉快;...
期刊:
中国血吸虫病防治杂志,2004年16(4):257-260 ISSN:1005-6661
作者机构:
南华大学医学院寄生虫学教研室,衡阳,421001;[杨秋林; 廖力; 伍和平; 张愉快; 肖建华; 梁瑜] 南华大学
关键词:
日本血吸虫;磷酸甘油酸激酶;基因;克隆;序列分析
摘要:
目的克隆日本血吸虫磷酸甘油酸激酶(SjPGK)编码基因片段,分析其核苷酸序列.方法根据曼氏血吸虫磷酸甘油酸激酶(SmPGK)cDNA 序列设计并合成一对引物,以日本血吸虫成虫总RNA为模板,采用逆转录-聚合酶链反应( RT-PCR )特异性扩增SjPGK基因片段,将其克隆入pMD18-T载体中,经双酶切分析和PCR鉴定,将阳性克隆进行脱氧核糖核酸序列测定;运用BLAST程序,将测序结果及其推导的编码氨基酸序列与NCBI数据库在核苷酸水平和氨基酸水平进行同源性比较.结果 RT-PCR特异性扩增出一条长约830 bp的条带;重组质粒的双酶切和以其脱氧核糖核酸为模板的PCR均可见一条与RT-PCR产物相同的条带;脱氧核糖核酸序列测定和分析结果表明:SjPGK基因片段长为 830 bp ,与 SmPGK 的核苷酸同源性为 85%,分值为672;氨基酸同源性为94%,分值为473.结论成功地克隆了SjPGK 编码基因片段,为寻找日本血吸虫新的抗感染疫苗候选分子奠定基础.
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日本血吸虫表达序列标签的获取和分析
作者:
曾桥;肖建华;万志刚;张愉快;刘传爱;...
期刊:
中南医学科学杂志,2004年32(1):8-12 ISSN:2095-1116
作者机构:
[万志刚; 杨秋林; 刘传爱; 曾桥; 张愉快; 肖建华] 南华大学
关键词:
日本血吸虫(中国大陆株);cDNA文库;表达序列标签
摘要:
目的运用表达序列标签(expressed sequence tag, EST)技术,从日本血吸虫成虫cDNA文库中分离、鉴定和分析表达基因序列,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点.方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,将获取的EST登录GenBank,并进行生物信息学分析.结果随机挑取382 个阳性克隆进行测序,获得149个EST(登录号分别为:CA747382~CA747391, BU917055~BU917058, CA305307~CA305309, BU581980, BU582400~BU582403, BU666906和CA946548~CA946666),同源性比较发现,部分序列与血吸虫的生活史的不同阶段和不同性别序列有一定的同源性.结论 EST技术有助于快速、经济地获取和研究日本血吸虫表达基因.
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日本血吸虫SjBT基因的获得与生物信息学分析
作者:
廖力;肖建华;王可耕;曾桥;梁瑜;...
期刊:
中国病原生物学杂志,2004年17(2):114-116 ISSN:1673-5234
作者机构:
南华大学寄生虫学教研室,湖南衡阳,421001;[杨秋林; 王可耕; 廖力; 曾桥; 肖建华; 梁瑜] 南华大学
关键词:
血吸虫;日本;微管蛋白;生物信息学;表达序列标签;步移法
摘要:
目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum, Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新基因,为防治日本血吸虫病提供药物靶标或候选疫苗. 方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库,用序列标签法随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取其全长cDNA,并进行生物信息学分析和登录. 结果获得了1个日本血吸虫新基因,全长1 439 bp,编码443个氨基酸,与肝片形吸虫微管蛋白基因具有79%的同源性.编码蛋白的理论分子质量为7.219 8 ku,等电点为9.12;抗原表位可能位于cDNA序列373~396处. 结论表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术有利于发现日本血吸虫新基因.
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日本血吸虫乳酸脱氢酶基因的获得和序列分析
作者:
刘传爱;肖建华;梁瑜;曾桥;万志刚;...
期刊:
实用预防医学,2004年11(01):17-20 ISSN:1006-3110
作者机构:
南华大学病原生物所实验中心,中国湖南,衡阳,421001
关键词:
日本血吸虫;乳酸脱氢酶;表达序列标签;步移法;生物信息学
摘要:
目的 从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中筛选日本血吸虫新基因 ,为日本血吸虫病的诊断或防治提供靶抗原。 方法 筛选日本血吸虫成虫cDNA文库 ,随机挑取重组阳性克隆进行DNA测序 ,再对新基因序列进行步移法测序获取全长cDNA ,并利用生物信息学技术对其进行分析。 结果 获得了 1个新基因 ,其cDNA全长 12 5 1bp(AY2 2 5 190 ) ,编码 3 3 1个氨基酸 ,编码蛋白与人类或螈、蟾蜍、鸡、鼠及猪等其它生物的乳酸脱氢酶高度同源。 结论 利用表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术三者相结合 ,成功获得了编码日本血吸虫乳酸脱氢酶基因的cDNA全长序列。
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日本血吸虫组织蛋白酶B肽链内切酶基因的获得及结构与功能分析
作者:
胡永轩;肖建华;曾桥;万志刚;张愉快;...
期刊:
中国人兽共患病学报,2004年20(9):790-793 ISSN:1002-2694
作者机构:
[胡永轩; 肖建华; 曾桥; 万志刚; 张愉快; 黄家芳] 南华大学病原生物研究所;南华大学病原生物研究所 衡阳421001
关键词:
日本血吸虫;cDNA文库;克隆;步移法;生物信息学;组织蛋 白酶B肽链内切酶
摘要:
目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum, Sj)中国大陆株(chinese mainland strain)成虫cDNA文库中获得日本血吸虫新基因-组织蛋白酶B内切酶基因(Cathepsin B endopeptidase),利用生物信息学技术对其结构和功能进行分析和预测. 方法从已构建好的日本血吸虫成虫cDNA文库中挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA,并进行生物信息学分析和登录;使用NCBI,SAPS,TMHMM,Signal,Psort II,Protscale和Scanprosite等软件对新基因的结构和功能进行分析和预测.结果对382个阳性克隆进行测序,获得部分新基因,其中包括组织蛋白酶B内切酶基因(AY226984).利用Internet在线分析和相关生物信息学软件对新基因的结构和功能进行了分析和预测.结论日本血吸虫组织蛋白酶B内切酶基因所编码蛋白为一跨膜蛋白,含有半胱胺酸蛋白酶结构域,可能对宿主血红蛋白具有降解作用,从而在日本血吸虫生长、发育过程中发挥作用.
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日本血吸虫微管蛋白基因的获得和分析
作者:
廖力;肖建华;王可耕;曾桥;梁瑜;...
期刊:
美国中华临床医学杂志,2004年006(1):54-58 ISSN:1527-9251
作者机构:
南华大学寄生虫学教研室,湖南衡阳421001
关键词:
日本血吸虫;微管蛋白基因;公共卫生;菌种;基因序列
摘要:
目的从日本血吸虫(schistosoma japonicum,Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新的表达基因,为日本血吸虫病的防治提供药物靶标或侯选疫苗。方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA,并进行生物信息学分析和登录。结果获得了1个日本血吸虫新基因,全长1439bp,编码443个氨基酸,与肝片形吸虫微管蛋白基因具有79%的同源性。结论表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术三者相结合,有利于发现日本血吸虫新基因。
语种:
中文
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日本血吸虫睾丸增强转录蛋白样蛋白基因的获得和分析
作者:
张愉快;肖建华;刘彦;曾桥;汪志刚;...
期刊:
实用预防医学,2004年11(4):661-664 ISSN:1006-3110
作者机构:
南华大学病原生物学研究所,中国湖南,衡阳,421001;[汪志刚; 刘彦; 曾桥; 曾谷清; 肖建华; 张愉快] 南华大学
关键词:
日本血吸虫;cDNA文库;步移法;生物信息学;睾丸增强转录蛋白样蛋白;基因
摘要:
目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum, Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新的蛋白基因,为日本血吸虫病的防治提供侯选疫苗和药物靶点. 方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA,登录GenBank,利用BLAST程序对同源性高的基因进行核苷酸和氨基酸水平的同源性比较;并利用pcgene软件对其蛋白质结构进行初步分析. 结果获得了1个日本血吸虫新基因睾丸增强转录蛋白样蛋白(testis-enhanced transcript protein-like protein,AY336499), 长1 053 bp,编码219个氨基酸,与睾丸增强转录蛋白样蛋白具有55%的同源性,编码蛋白的理论分子量为7.2198 KDa,等电点为9.12;抗原表位可能位于cDNA序列373~396处. 结论步移法测序和生物信息学技术相结合有利于发现日本血吸虫新基因.
语种:
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