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梅毒螺旋体溶血素生物信息学分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
吴移谋;李思佳;李威威;杨鸿钰;唐园园;...
作者机构:
[李思佳; 唐园园; 杨鸿钰; 吴移谋; 李威威; 余翔; 王建业] 南华大学衡阳医学院病原生物研究所,湖南省衡阳市421001
语种:
中文
关键词:
梅毒螺旋体;溶血素蛋白家族;基因特征
关键词(英文):
Treponema pallidum;hemolysin family proteins;gene characteristics
期刊:
中南医学科学杂志
ISSN:
2095-1116
年:
2022
卷:
50
期:
5
页码:
642-646
基金类别:
31872643:国家自然科学基金 CX20210956:湖南省研究生科研创新项目
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
医学院
摘要:
目的 本研究旨在对梅毒螺旋体(Tp)的5种溶血素进行进一步的生物信息学分析,为后续研究溶血素家族蛋白在Tp致病过程中的致病机制提供依据.方法 通过使用NCBI、BLAST、CDD、BioEdit、ExPASy、SignalP、TMHMM、MEGA、PSORTb 3.0、ABCpred等生物信息学分析方法分析梅毒螺旋体溶血素家族蛋白的一般性质、信号肽、糖基化、磷酸化位点、亚细胞位置、二级结构、功能结构域及抗原表位.结果 预测了Tp中5个溶血素家族蛋白一般性质,Tp1037功能结构域不同于其余4种,Tp0028含有1个信号肽,Tp0027含有1个糖基化位点,Tp0027和Tp1037有多个跨膜结构域,5个溶血素家族蛋白均含有多个磷酸化位点和B细胞、T细胞表位.结...
摘要(英文):
Aim The purpose of this study was to conduct further bioinformatics analysis of the five hemolysin oftreponema pallidum,and to provide evidence for the pathogenic mechanism of hemolysin family proteins in the pathogene-sis oftreponema pallidum.Methods:The general properties of the syphilis family proteins,signal peptides,glycosyla-tion,phosphorylation sites,subcellular positions,secondary structures,functional domains,and antigen epitopes were ana-lyzed by bioinformatic analysis methods using NCBI,BLAST,CDD,BioEdit,ExPASy,SignalP,TMHMM,MEGA,PSORTb 3.0,ABCpred andother bioinformatics analysis m...

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