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高通量筛选DNA加合物位点方法的探讨

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成果类型:
期刊论文
作者:
奉水东;张洪霞;陈锋;凌宏艳;徐顺清
作者机构:
南华大学公共卫生学院流行病学教研室,湖南衡阳,421001
中南大学公共卫生学院卫生毒理学教研室
南华大学公共卫生学院院长办公室
南华大学医学院生理学教研室
华中科技大学同济医学院环境医学研究所
语种:
中文
关键词:
DNA加合物;结合位点;高通量
关键词(英文):
binding site;high throughput
期刊:
中国公共卫生
ISSN:
1001-0580
年:
2005
卷:
21
期:
6
页码:
671-672
基金类别:
国家自然科学基金资助(30170793);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
医学院
公共卫生学院
摘要:
目的探讨建立一种高通量的筛选DNA加合物结合位点的方法.方法以烷化剂氮芥处理人肝瘤HepG2细胞形成DNA加合物模型,利用基因表达系列分析技术(serrial analysis of gene expression,SAGE)对连接介导聚合酶链式反应(ligation mediated PCR,LMPCP)进行改良,以改良后的方法进行检测.结果 PCR扩增产物大小约为75 bp,与理论设计相符合.结论该方法的设计合理、可行.
摘要(英文):
Objective To develop a high throughput method of screening the binding site of DNA adducts.Methods The human liver tumor HepG2 cells were first treated with lng/μl nitrogen mustard for 3h and total DNA was extracted,then serrial analysis of gene expression was used for reference to improve ligation mediated PCR to detect the adducted site by nitrogen mustard in the cell genome.Results PCR product corresponded to 75 base pairs approximately.Concl...

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