本发明提供了鼠疫耶尔森菌毒力调控子TyrR及其应用。本发明发现鼠疫耶尔森菌TyrR缺失株的毒力较野生株下降约1万倍,缺失TyrR不影响该菌的体外生长,且TyrR能负调控五种芳香簇氨基酸代谢基因aroF-tyrA,aroP,aroL和tyrP的转录及正调控2个酸应答基因hdeB和hdeD,证实TyrR是鼠疫耶尔森菌的一个毒力调控子。在pH5.0环境中,鼠疫耶尔森菌TyrR突变株的生存率和生长速度较野生株降低,说明TyrR突变株抗酸能力下降,证实TyrR调控子跟菌的抗酸性密切相关。本发明提供了鼠疫耶尔森菌毒力调控子TyrR在制备预防鼠疫疫苗中的应用,以及在制备以TyrR为靶标的药物中的应用。