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Hsa-miR-139-3p靶基因预测及生物信息学分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
何楚琦;钟浩;龙鼎新
作者机构:
南华大学公共卫生学院,湖南 衡阳,421001
[龙鼎新; 钟浩; 何楚琦] 南华大学
语种:
中文
关键词:
靶基因预测;生物信息学
关键词(英文):
hsa-miR-139-3p
期刊:
中国现代医学杂志
ISSN:
1005-8982
年:
2019
卷:
29
期:
17
页码:
22-28
基金类别:
No81673227:国家自然科学基金 81172712:国家自然科学基金
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
公共卫生学院
摘要:
目的对hsa-miR-139-3p 的靶基因进行预测及相关生物信息学分析,为hsa-miR-139-3p 靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础。方法采用3 种软件预测hsa-miR-139-3p 的靶基因并对结果进行功能注释(GO)和信号通路富集分析(KEGG)。结果 hsa-miR-139-3p 成熟序列在各物种间高度保守。获得的133 个靶基因存在于细胞各个组分,主要有转录调控、基因表达调控和蛋白连接等分子功能,并富集于发育生物学过程,涉及黏着斑信号转导以及基因信息处理等信号通路。结论 hsa-miR-139-3p 通过调控靶基因参与人类生命活动和疾病过程的很多方面,尤其生长发育和癌症过程是值得进一步研究的方向。
摘要(英文):
Objective To predict the target genes of hsa-miR-139-3p and provide the theoretical basis for its experimental verification and regulation study. Methods Three tools were utilized to predict target genes of hsa-miR- 139-3p, which were analyzed by Gene Ontology and KEGG pathway. Results Hsa-miR-139-3p sequence was highly conserved among different species. Totally 133 target genes were identified, which potentially regulated function such as gene transcription, gene expression and protein connection. Target genes were involved in biological development process. KEGG analysis suggested that those...

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