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Identification and bioinformatic function analysis of p53-related differentially expressed IncRNAs in γ-rays irradiated-human bronchial epithelial HBE cells

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成果类型:
期刊论文
作者:
胡赛;黄瑞雪;周平坤;黄波
通讯作者:
Huang, B.
作者机构:
[胡赛; 黄波] School of Public Health, University of South China, Hengyang, 421001, China
[黄瑞雪] School of Public Health, Central South University, Changsha, 410078, China
[周平坤] Beijing Key Laboratory for Radiobiology, Institute of Radiation Medicine, Academy of Military Medical Sciences, Academy of Military Sciences, Beijing, 100850, China
通讯机构:
[Huang, B.] S
School of Public Health, University of South China, Hengyang, China
语种:
中文
关键词:
射线;长链非编码RNA;支气管上皮细胞
关键词(英文):
p53
期刊:
中国药理学与毒理学杂志
ISSN:
1000-3002
年:
2020
卷:
33
期:
8
页码:
587-594
基金类别:
National Natural Science Foundation of China (U1803124)
机构署名:
本校为第一且通讯机构
院系归属:
公共卫生学院
摘要:
目的 鉴定人支气管上皮HBE细胞中p53相关的γ射线诱导表达的长链非编码RNA(IncRNA)分子,为研究与p53关联的IncRNA分子在放射损伤反应如上皮间充质转化中的作用机制提供信息.方法 使用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建p53敲除的人支气管上皮细胞(HBEp53-/-),Western印迹法检测P53表达水平,IncRNA芯片杂交分析IncRNA表达谱的改变,实时定量RT-PCR分析验证部分IncRNA分子的表达变化,生物信息学技术分析差异变化IncRNA的生物学功能.结果 与野生型HBE细胞相比,HBEp53-/-细胞在照射后有239条IncRNA出现上调表达,287条出现下调表达.上调和下调表达前5位IncRNA的差异表达变化经PCR得到验证.生物信息学GO分析表...
摘要(英文):
OBJECTIVE: To identify the differentially expressed long non-coding RNAs (IncRNAs) in γ-rays irradiated p53 knockout HBE (HBEp53-/-) cells, and to provide more baseline information for further investigation of p53 related IncRNAs in irradiation-induced injury, such as epithelial-mesenchymal transition in lung tissue epithelial cells. METHODS: HBEp53-/-cells were established with CRISPR-cas9. Western blotting was used to detect the knockout efficacy of P53 protein, while real time RT-PCR was used to verify the selected expressions of IncRNAs. B...

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