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基于关联网络的空间辐射防护分子靶标的辨识与预测

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成果类型:
期刊论文
论文标题(英文):
Identification and prediction of molecular targets related to space radiation protection based on associated networks
作者:
谢达菲;关华;樊婵;胡赛;刘晓丹;...
通讯作者:
Zhang, H.
作者机构:
军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所放射生物学研究室,北京100850
湖南医药学院检验医学院,怀化418000
南华大学公共卫生学院,衡阳421300
中国科学院近代物理研究所,兰州730000
通讯机构:
Institute of Modern Physics, Chinese Academy of Sciences, Lanzhou, China
语种:
中文
关键词:
基因表达谱;蛋白质相互作用网络;药物靶标;重离子;模拟退火算法
关键词(英文):
Drug target;Gene expression profiles;Heavy ion;Protein-protein interaction network;Simulated annealing algorithm
期刊:
科学通报
ISSN:
0023-074X
年:
2020
卷:
65
期:
5
页码:
392-400
基金类别:
国家自然科学基金(11705283); 中国科学技术协会“青年人才托举工程”项目(CSTQT2017003); 全军医学科技青年培育计划孵化项目(17QNP037); 军事医学科学院军事医学创新基金(2017CXJJ18)资助;
机构署名:
本校为其他机构
院系归属:
公共卫生学院
摘要:
空间辐射对航天员健康的危害制约人类的空间探索活动,对其中重离子成分的医学防护研究是对抗空间辐射人体健康威胁的关键之一.本研究以地面装置模拟空间辐射环境,用0.5和2 Gy剂量的碳离子(~(12)C~(6+))辐照正常人淋巴母细胞AHH-1,照前0.5 h分别用两种已知的辐射防护药物处理细胞,照后4 h用基因表达芯片测量细胞基因表达谱,构建辐射损伤相关基因表达量调节网络.运用基于模拟退火的迭代搜索算法辨识不同剂量~(12)C~(6+)辐照及防护药物作用下的辐射相关基因激活子网,依据节点的连接度预测出PPM1A, RIF1, CASP3, TFE3和RIN1等潜在的空间辐射损伤防护高关联度基因.进一步的富集分析表明,这些基因显著...
摘要(英文):
The effect of cosmic radiation on astronauts is a major barrier for human space exploration. In particular, medical protection against heavy ion radiation-induced injury is one of the key approaches in counteracting cosmic radiation to humans. In recent years, with the rapid accumulation of high-throughput data including gene expression profiles and omics-based data such as protein-protein interactions (PPI), large-scaled network pharmacology analyses can now be conducted. Exploring human genes with potentially high correlation to protection ag...

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