了解COVID-19流行期间（2020-2022年）深圳地区手足口病（Hand,food and mouth disease,HFMD）优势病原体柯萨奇病毒A6（Coxackieviurs A6, CVA6）的流行情况以及其VP1区的分子特征，为有效预防HFMD提供科学依据。2020-2022年深圳市疾病预防控制中心收集手足口病哨点监测病例样本共1 733份。采用实时荧光RT-PCR方法对标本进行肠道病毒核酸检测。随机挑选分布于不同月份经RT-PCR判定为CVA6阳性的样本共108例进行VP1全长基因序列扩增和测序。使用生物信息学软件对CVA6进行分子系统发育与氨基酸变异分析。1 733份手足口病病例标本中，检出EV阳性1 627份，总检出率为94.65%（1627/1733）；检出CVA6阳...
