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鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
侯德富;关勇军;关瑞;万恂恂;李国庆;...
作者机构:
中南大学湘雅医院卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室,长沙410008
中南大学肿瘤研究所,长沙410008
湖南师范大学医学院生物化学与分子生物学教研室,长沙410013
中南大学肿瘤研究所,长沙,410008
南华大学药学与生命科学学院生物科学系,衡阳421001
语种:
中文
关键词:
NPCEDRG基因;mRNA剪接变异体
关键词(英文):
5'-RACE;3'-RACE;RT-PCR;alternative splicing variants;5′-RACE;3′-RACE;RT-PCR
期刊:
中国生物化学与分子生物学报
ISSN:
1007-7626
年:
2011
卷:
27
期:
9
页码:
841-850
基金类别:
国家自然科学基金项目(No.30772401)~~;
机构署名:
本校为其他机构
院系归属:
药学与生物科学学院
摘要:
NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的1个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.本研究对CNE2细胞所表达的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体克隆、鉴定,发现NPCEDRG基因至少有7个转录起始位点,其中NM_032316的TSS位于ATG上游- 85 nt处,AF538150和AK094248的TSS位于- 25 nt处;AF538150不存在第2外显子中6核苷酸序列(3′-TTGCAG-3′)的缺失,其CDs为516 bp,编码1种由171个氨基酸组成的蛋白质(而非GenBank中公布的CDs为510 bp,1种由169个氨基酸组成的蛋白质).本研究成功克隆得到1种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接...
摘要(英文):
NPCEDRG is an NPC associated gene discovered by positional cloning from the patients in Hunan province in southern China,which is localized at a region frequently linked to NPC susceptibility at 3p21.3.Here we have identified at least seven possible alternative splicing(AS) variants of NPCEDRG transcripts in CNE2 cells,encoding 3 protein isoforms consist of 213,171 and 98 amino acids(aa).Seven possible TSSs were determined by 5′-RACE.As previously reported,the TSSs of variants NM_032316 and AK094248 were located-85 and-25 nt upstream of th...

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