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人肺腺癌转移差异蛋白质生物信息学分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
邵美英;刘迎福;陈主初;李国庆
作者机构:
中南大学湘雅医院 抗癌药物国家地方联合工程实验室 结构生物学与药物设计湖南省工程实验室 卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室,长沙,410008
410008长沙,中南大学湘雅医院 抗癌药物国家地方联合工程实验室 结构生物学与药物设计湖南省工程实验室 卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室
厦门大学医学院基础医学部
南华大学药学与生物科学学院
[李国庆; 陈主初; 刘迎福; 邵美英] 中南大学湘雅医院
语种:
中文
关键词:
肺肿瘤/病理学;腺癌/病理学;蛋白质组学;蛋白质相互作用域和基序;肿瘤转移
关键词(英文):
Lung neoplasms/pathology;Adenocarcinoma/pathology;Proteomics;Protein interaction domains and motifs;Neoplasm metastasis
期刊:
中国医师杂志
ISSN:
1008-1372
年:
2014
卷:
16
期:
8
页码:
1047-1051
基金类别:
湖南省科研条件创新专项基金(2011TT2015);
机构署名:
本校为其他机构
院系归属:
药学与生物科学学院
摘要:
目的 对无转移肺腺癌和有转移肺腺癌表达差异蛋白质进行生物信息学分析.方法 利用Cytoscape软件对前期发现无转移肺腺癌和有转移肺腺癌表达差异的20个蛋白质进行基因本体论(GO)功能富集分析和蛋白质相互作用网络构建.结果 20种肺腺癌转移差异表达蛋白质的主要生物学过程为葡萄糖分解和酒精分解等过程,主要分子功能为磷脂酶A2抑制剂活性和钙依赖的磷脂结合,蛋白质相互作用网络为包含245种不同蛋白质和230种不同蛋白质相互作用关系.结论 葡萄糖分解过程、酒精分解过程、磷脂酶A2抑制剂活性和钙依赖的磷脂结合及ACTB、ANXA1、ANXA2、ANXA3、VCP、NPM1、KRT1、SUMO4等关键蛋白质在人肺腺癌转移过程...
摘要(英文):
Objective To investigate the biological significance of differentially expressed proteins from human primary lung adenocarcinoma with lymph node metastasis adenocarcinoma (LNM AdC) and without metastasis (non-LNM AdC) according to clinical diagnosis of lymph node metastasis and distant metastasis,with bioinformatics approach.Methods Cytoscape software was used to analyze a functional enrichment analysis and a protein-protein interaction network from differentially expressed proteins from LNM AdC and non-LNM AdC.Results The top biological pr...

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