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实验红鲫线粒体DNA 条形码特征分析及应用

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成果类型:
期刊论文
论文标题(英文):
Characteristics analysis and application of mitochondrial DNA barcoding in laboratory red crucian carp (Carassius carassius, red variety)
作者:
王余德;李登科;陈科洁;吴端生;刘少军
作者机构:
[王余德; 刘少军] 湖南师范大学生命科学学院省部共建淡水鱼类发育生物学国家重点实验室
[李登科; 陈科洁] 南华大学实验动物学部
[吴端生] 湖南师范大学生命科学学院省部共建淡水鱼类发育生物学国家重点实验室<&wdkj&>南华大学实验动物学部
语种:
中文
关键词:
实验红鲫;线粒体DNA;DNA条形码;系统进化树
期刊:
水产学报
ISSN:
1000-0615
年:
2021
卷:
45
期:
01
页码:
1-9
基金类别:
“十二五”国家科技支撑计划(2015BAIO9BO5); 湖南省科学技术厅科技计划重点项目(2014TT1002); 中国博士后基金(2019M662788)~~;
机构署名:
本校为其他机构
院系归属:
药学与生物科学学院
摘要:
为探索建立具有实验红鲫品系特异性的线粒体DNA条形码,对鲫属品种进行鉴定。本研究以实验红鲫和鲫属其他鱼类(洞庭湖鲫、日本白鲫、大眼鲫、兰氏鲫、金鱼、湘军金鱼和湘军花鲫)为测试群体,利用Sanger测序对所有个体的线粒体COⅠ、COⅢ、Cytb这3个基因和D-loop进行测序,同时构建3个基因的拼接序列,并分析它们的序列特征和10种鲫属鱼类分子系统进化的聚类特征。结果显示,COⅠ、COⅢ、Cytb这3个基因的拼接序列和COⅠ基因的进化树聚类能明显地发现10种不同的鲫属鱼类聚成不同的小支,而COⅢ基因和D-loop序列聚类不能同时区分10种鲫属鱼类。研究表明,通过COⅠ基因以及3个基因的拼接序列均能有效地鉴...
摘要(英文):
To explore and effectively identify the laboratory red crucian carp's mitochondrial DNA barcode, we have identified the species of crucian carp. This research based on the laboratory red crucian carp and the other species of crucian carp (Dongting lake crucian carp, Japanese white crucian carp, Carassius auratus grandoculis, C. auratus langsdorfii, goldfish, goldfish-like fish and red crucian carp-like fish) as the test group, using Sanger sequencing for all individual mitochondrial COⅠ, COⅢ, Cytb, D-loop sequencing, and built the three gene ...

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