新型冠状病毒实验室检测方法研究进展
作者:
张雪冰;潘纹玉;陈丽丽
期刊:
病毒学报 ,2021年37(02):428-434 ISSN:1000-8721
作者机构:
[张雪冰; 陈丽丽] 南华大学公共卫生学院卫生检验系;[潘纹玉] 株洲市疾病预防控制中心
关键词:
核酸检测;抗原抗体检测
摘要:
世界范围内流行的SARS-CoV-2已造成大批新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者,严重威胁着全人类生命健康。新型冠状病毒肺炎尚没有特效药,也没有疫苗,实验室确诊新型冠状病毒肺炎,隔离传染源,尽早治愈患者对整个疫情防控起着非常重要的作用。目前实验室检测方法有病毒分离培养、实时荧光定量PCR、环介导等温扩增技术、CRISPR/Cas技术、测序技术、基因芯片和抗原抗体检测。本文就上述几种方法做一综述,为确诊COVID-19提供参考。
语种:
中文
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Characteristics of Atmospheric Fine Particulate Matter (PM_(2.5)) Induced Differentially Expressed Proteins Determined by Proteomics and Bioinformatics Analyses
作者:
Zheng Kai;Cai Ying;Wang Bing Yu;Qin Shuang Jian;Li Bo Ru;...
期刊:
生物医学与环境科学:英文版 ,2020年33(8):583-592 ISSN:0895-3988
通讯作者:
Xu Xin Yun
作者机构:
[Long Ding Xin; Wang Bing Yu; Zhang Zhao Hui; Cai Ying; Zheng Kai] Univ South China, Sch Publ Hlth, Hengyang 421001, Hunan, Peoples R China.;[Li Bo Ru; Wang Bing Yu; Xu Xin Yun; Qin Shuang Jian; Cai Ying; Qin Xiao Yun; Zheng Kai; Huang Hai Yan] Shenzhen Ctr Dis Control & Prevent, Inst Environm & Hlth, Shenzhen 518055, Guangdong, Peoples R China.;[Li Bo Ru; Qin Shuang Jian] Cent South Univ, Xiangya Sch Publ Hlth, Changsha 410078, Hunan, Peoples R China.
通讯机构:
[Xu Xin Yun] S;Shenzhen Ctr Dis Control & Prevent, Inst Environm & Hlth, Shenzhen 518055, Guangdong, Peoples R China.
关键词:
Bioinformatics;Differentially expressed proteins;PM2.5;Proteomics;Weighted correlation network analysis
摘要:
Objective To screen the differentially expressed proteins (DEPs) in human bronchial epithelial cells (HBE) treated with atmospheric fine particulate matter (PM2.5). Methods HBE cells were treated with PM2.5 samples from Shenzhen and Taiyuan for 24 h. To detect overall protein expression, the Q Exactive mass spectrometer was used. Gene ontology (GO), Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG), and Perseus software were used to screen DEPs. Results Overall, 67 DEPs were screened in the Shenzhen sample-treated group, of which 46 were upregulated and 21 were downregulated. In total, 252 DEPs were screened in the Taiyuan sample-treated group, of which 134 were upregulated and 118 were downregulated. KEGG analysis demonstrated that DEPs were mainly enriched in ubiquitin-mediated proteolysis and HIF-1 signal pathways in Shenzhen PM2.5 samples-treated group. The GO analysis demonstrated that Shenzhen sample-induced DEPs were mainly involved in the biological process for absorption of various metal ions and cell components. The Taiyuan PM2.5-induced DEPs were mainly involved in biological processes of protein aggregation regulation and molecular function of oxidase activity. Additionally, three important DEPs, including ANXA2, DIABLO, and AIMP1, were screened. Conclusion Our findings provide a valuable basis for further evaluation of PM2.5-associated carcinogenesis.
语种:
英文
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Proteomics Study on the Differentially Expressed Proteins in c-fos-silenced Cells Exposed to PM_(2.5)
作者:
Cai Ying;Zheng Kai;Li Run Bing;Yu Shu Yuan;Liu Ning;...
期刊:
生物医学与环境科学:英文版 ,2020年33(9):680-689 ISSN:0895-3988
通讯作者:
Zhang Zhao Hui;Xu Xin Yun
作者机构:
[Zhang Zhao Hui; Cai Ying; Li Run Bing; Zheng Kai] Univ South China, Sch Publ Hlth, Hengyang 421001, Hunan, Peoples R China.;[Ji Jia Jia; Yu Shu Yuan; Li Bo Ru; Wu De Sheng; Xu Xin Yun; Qin Shuang Jian; Liu Ning; Cai Ying; Li Run Bing; Zheng Kai; Yang Chen] Shenzhen Ctr Dis Control & Prevent, Inst Environm & Hlth, Shenzhen 518055, Guangdong, Peoples R China.;[Li Bo Ru; Qin Shuang Jian] Cent South Univ, Xiangya Sch Publ Hlth, Changsha 410078, Hunan, Peoples R China.
通讯机构:
[Zhang Zhao Hui] U;[Xu Xin Yun] S;Univ South China, Sch Publ Hlth, Hengyang 421001, Hunan, Peoples R China.;Shenzhen Ctr Dis Control & Prevent, Inst Environm & Hlth, Shenzhen 518055, Guangdong, Peoples R China.
关键词:
Bioinformatics;Gene silence;Human bronchial epithelial cells;PM2.5;Proteomics
摘要:
Objective: To investigate the effect of c-fos gene silencing on differentially expressed proteins (DEPs) in human bronchial epithelial (HBE) cells after exposure to fine particulate matter (PM2.5). Methods: HBE cells and c-fos-silenced HBE cells were exposed to 50 µg/mL PM2.5, LC-MS/MS and tandem mass tag (TMT) labeling methods were combined with bioinformatics methods, and DEPs and interaction networks were identified. Results: In the HBE group, 414 DEPs were screened, of which 227 were up-regulated and 187 down-regulated. In the c-fos silenced HBE group, 480 DEPs were screened, including 240 up-regulated proteins and 240 down-regulated proteins. KEGG annotations showed that DEPs in the HBE group are mainly concentrated in the glycolysis/gluconeogenesis pathway and those in the c-fos silenced group are concentrated mainly in endoplasmic reticulum and the processing of proteins. Additionally, the abnormal expression of GPRC5C, DKK4, and UBE2C was identified in top 15 DEPs. After constructing the protein interaction network, 20 Hub proteins including HNRNPA2B1, HNRNPL, RPS15A, and RPS25 were screened from the HBE group and the c-fos silenced HBE group. Conclusion: c-fos gene affected the expression of cancer-related proteins. Our results provided a scientific basis for further study of PM2.5-induced carcinogenesis mechanism. © 2020 The Editorial Board of Biomedical and Environmental Sciences
语种:
英文
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湖南地区社区成年居民体质指数、腰围与H型高血压患病关系
作者:
张影;王佳;曾丹;李璟;陈建;...
期刊:
中国公共卫生 ,2020年36(5):757-760 ISSN:1001-0580
作者机构:
[曾丹; 张丹丹; 李璟; 陈建; 张影; 王佳; 洪秀琴] 湖南省人民医院;湖南师范大学附属第一医院;南华大学公共卫生学院;湖南师范大学转化医学研究所流行病学研究室
关键词:
H型高血压;体质指数(BMI);腰围(WC);关系;社区成年居民
摘要:
目的了解湖南地区社区成年居民体质指数(BMI)、腰围(WC)与H型高血压患病的关系,为H型高血压的早期预防和社区防治提供科学依据。方法于2013年6月— 2014年5月采用多阶段随机整群抽样方法在湖南省长沙、衡阳、永州、株洲、湘西、岳阳6个地区抽取4 012名≥ 30岁社区成年居民进行问卷调查、体格检查和实验室检测。结果湖南地区4 012名社区成年居民中,低体重218人(5.4 %),正常体重2 210人(55.1 %),超重1 241人(30.9 %),肥胖343人(8.5 %);非中心性肥胖1 513人(37.7 %),中心性肥胖2 499人(62.3 %)。湖南地区低体重、正常体重、超重和肥胖社区成年居民的H型高血压患病率分别为12.39 %、15.57 %、23.93 %和35.57 %,非中心性肥胖和中心性肥胖社区成年居民的H型高血压患病率分别为12.82 %和23.85 %,不同BMI、WC社区成年居民H型高血压患病率比较,差异均有统计学意义(均P < 0.001)。在调整了性别、年龄、文化程度、婚姻状况、吸烟情况和饮酒情况等混杂因素后,多因素非条件logistic回归分析结果显示,超重(OR = 1.783, 95 % CI = 1.486~ 2.140)、肥胖(OR = 3.256,95 % CI = 2.505~4.233)和中心性肥胖(OR = 2.198,95 % CI = 1.829~2.641)是湖南地区社区成年居民H型高血压患病的危险因素,低体重(OR = 0.547, 95 % CI = 0.352~0.851)是湖南地区社区成年居民H型高血压患病的保护因素。结论湖南地区社区成年居民BMI和WC与H型高血压患病具有相关性。
语种:
中文
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肺纤维化circRNA及miRNA芯片数据挖掘及生物信息学分析
作者:
刘艳萍;雷媛娣;蔡颖;袁小燕;王烨;...
期刊:
生命的化学 ,2020年40(10):1850-1860 ISSN:1000-1336
作者机构:
南华大学公共卫生学院,衡阳421001;[邓伟华; 张朝晖; 孙站兵; 雷媛娣; 蔡颖; 王烨; 刘艳萍; 袁小燕] 南华大学
关键词:
肺纤维化;生物信息学
摘要:
肺纤维化是一种进展的致死性呼吸系统疾病,预后较差且缺乏特效的治疗方法。研究发现,环状RNA(circular RNA, circRNA)和微小RNA(microRNA, miRNA)作为内源性非编码RNA分子可参与多种生物学过程,在肺纤维化的发生发展中起重要作用。本研究利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)、GEO2R工具筛选肺纤维化相关的差异表达circRNA及miRNA,使用circular RNA Interactom预测与差异表达circRNA结合的miRNA,用TargetScan、miRDB及miRWalk预测miRNA靶基因,并用DAVID对靶基因进行GO分析和KEGG功能分析,用STRING对靶基因进行蛋白质相互作用预测。结果显示,共筛选出肺纤维化相关的差异表达的circRNA、miRNA分别有18个和21个,预测了与差异表达的circRNA相互作用的miRNA及mRNA,并构建了circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络图。 DAVID基因功能富集分析发现,circRNA可能通过AMPK信号通路参与肺纤维化过程。构建蛋白质相互作用网络图发现它的10个关键节点。研究结果旨在为circRNA及miRNA在肺纤维化中的发病机制研究提供参考,为肺纤维化治疗拓宽思路。
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中文
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一种简易大鼠非暴露式气管滴注方法的建立
作者:
王烨;孙梦婷;谭滇湘;雷媛娣;李鹏;...
期刊:
毒理学杂志 ,2020年34(02):176-178 ISSN:1002-3127
作者机构:
南华大学公共卫生学院,湖南衡阳421001;衡阳市中心医院,湖南衡阳421001;[李鹏; 谭滇湘] 衡阳市中心医院;[张朝晖; 雷媛娣; 蔡颖; 孙梦婷; 刘艳萍; 王烨; 袁小燕] 南华大学
关键词:
大鼠;非暴露式;气管插管;滴注;呼吸音
摘要:
常用的呼吸道染毒方法有暴露式气管滴注、鼻内滴注和非暴露式气管滴注.非暴露式气管滴注通过气管插管将滴注液输送到肺部,无需手术切口暴露气管,染毒剂量准确且对实验动物伤害较小.非暴露式气管滴注的方法有:盲探插管、透射光插管,使用光纤、喉镜、头戴式放大镜、内窥镜等辅助插管,但这些方法大多需要特殊设备,对于大鼠等小型哺乳类动物而言,由于其口腔、咽部解剖学情况使得插管较为困难,现今还没有标准的气管插管设备供大鼠使用,且操作技能要求较高[1-7].本课题组拟建立一种操作简单、安全性高、动物死亡率低、设备要求低的大鼠非暴露式气管滴注方法及其评价方法,现介绍如下.
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中文
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湖南省2009 - 2018年百日咳流行特征分析与发病趋势预测
作者:
谭慧仪;李纯颖;肖岚;刘富强;吴成秋
期刊:
中华疾病控制杂志 ,2020年24(11):1263-1268,1281 ISSN:1674-3679
作者机构:
421001衡阳,南华大学公共卫生学院;410005长沙,湖南省疾病预防控制中心公共卫生应急响应办公室;[李纯颖; 吴成秋; 肖岚; 谭慧仪] 南华大学;[刘富强] 湖南省疾病预防控制中心
关键词:
百日咳;流行病学特征;ARIMA模型;预测
摘要:
目的分析湖南省2009 - 2018年百日咳发病的流行病学特征,建立自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型,为百日咳疫情防控提供科学依据。方法收集传染病监测系统中2009 - 2019年的百日咳监测数据资料,分析2009 - 2018年百日咳流行病学特征,基于2009年1月- 2018年12月的百日咳月发病率资料建立预测模型,并对2020年百日咳发病趋势进行预测。结果2009 - 2018年湖南省共报告百日咳病例2 530例,年均报告发病率为0.371/10万; 5 - 9月为百日咳报告的高发月份, 10月-次年4月为低发月份;高发地区为娄底市、益阳市、长沙市、郴州市;男性发病率高于女性,报告病例主要为散居儿童、幼托儿童和学生。ARIMA(0,1,1) ×(0,1,0) 12为最优预测模型,2019年的发病与模型预测结果基本一致,预测2020年发病率为7.642/10万,高于2019年。结论湖南省2018年开始出现百日咳暴发流行,且发病率有持续走高趋势,可能存在“百日咳重现”现象。ARIMA模型在百日咳短期发病趋势预测中效果较好,预测2020年发病水平将继续升高,应结合湖南省百日咳流行病学特征及实际情况进行疫情防控策略调整。
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中文
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PM_(2.5)-induced Alterations of Gene Expression in HBE Cells Revealed by Gene Chip Analysis
作者:
Wang Bing Yu;Cai Ying;Zheng Kai;Huang Hai Yan;Qin Xiao Yun;...
期刊:
生物医学与环境科学:英文版 ,2020年33(3):213-216 ISSN:0895-3988
通讯作者:
Xu Xin Yun
作者机构:
[Wang Bing Yu; Cai Ying; Zheng Kai] Univ South China, Sch Publ Hlth, Hengyang 421001, Hunan, Peoples R China.;[Wang Bing Yu; Xu Xin Yun; Cai Ying; Qin Xiao Yun; Zheng Kai; Huang Hai Yan] Shenzhen Ctr Dis Control & Prevent, Inst Environm & Hlth, Shenzhen 518055, Guangdong, Peoples R China.
通讯机构:
[Xu Xin Yun] S;Shenzhen Ctr Dis Control & Prevent, Inst Environm & Hlth, Shenzhen 518055, Guangdong, Peoples R China.
关键词:
PM2.5;ABSORPTION;ABILITY;gene;chip;technology
摘要:
PM_(2.5) are fine inhalable particles with diameters that are generally 2.5 micrometers and smaller and are characterized by a small particle size, a large surface area, and a strong toxin absorption ability[1-3]. PM_(2.5) contains heavy metals and organic pollutants that are harmful to human health and exert carcinogenic, teratogenic, and mutagenic effects[4-7]. PM_(2.5) has been classified as a human carcinogen by the International Agency for Research on Cancer (IARC)[2]. The economy has developed rapidly making air pollution a serious environmental health problem in China. The purpose of this study was to explore the differentially expressed genes and pathways after a PM_(2.5) exposure in the human bronchial epithelial (HBE) cells via gene chip technology and bioinformatics analysis.
语种:
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p38MAPK基因沉默对PM_(2.5)染毒肝细胞后癌基因和凋亡基因表达的影响
作者:
王冰玉;秦双建;李闰冰;李柏茹;蔡颖;...
期刊:
中华劳动卫生职业病杂志 ,2020年38(10):721-725 ISSN:1001-9391
作者机构:
518055 深圳市疾病预防控制中心环境与健康所;421001 衡阳,南华大学公共卫生学院;410078 长沙,中南大学湘雅公共卫生学院
关键词:
肝细胞;基因沉默;细颗粒物;雾霾;凋亡基因;癌基因
摘要:
目的:研究p38丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)基因沉默对大气细颗粒物(PM
2.5)染毒肝细胞(L02细胞)相关基因表达的影响。
方法:于2019年6至9月,根据GenBank提供的p38MAPK基因序列,设计合成3条干扰序列,退火后连接到PLVX-shRNA2-puro中,将重组慢病毒载体转染L02细胞。用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)和蛋白免疫印迹(Western blotting)法对p38MAPK基因沉默效果进行鉴定。用浓度为50 μg/ml的PM
2.5水溶物和10 μmol/L阳性对照Cr
6+分别染毒L02细胞、p38MAPK基因沉默细胞24 h,同时设立空白对照组。用荧光定量PCR检测癌基因(c-fos、c-myc、k-ras)、抑癌基因(p53)和凋亡基因(Caspase-3、Caspase-8、Caspase-9)的相对表达水平。
结果:p38MAPK基因沉默细胞中p38MAPK基因和蛋白表达水平较正常L02细胞明显下降(
P<0.05),p38MAPK基因沉默细胞株构建成功。与空白对照组比较,PM
2.5染毒L02细胞组癌基因c-fos、c-myc、k-ras和凋亡基因Caspase-3、Caspase-8、Caspase-9表达水平升高,抑癌基因p53表达水平下降,差异均有统计学意义(
P<0.05);与PM
2.5染毒L02细胞组比较,PM
2.5染毒p38MAPK基因沉默细胞组癌基因c-fos、c-myc、k-ras和凋亡基因Caspase-3、Caspase-8、Caspase-9表达水平下降,抑癌基因p53表达水平升高,差异均有统计学意义(
P<0.05)。
结论:PM
2.5对L02细胞癌基因、抑癌基因和凋亡基因表达有明显影响,而p38MAPK基因沉默可抑制PM
2.5对L02细胞的影响。
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中文
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深圳市学龄女童膳食模式和性早熟的相关性研究
作者:
孟凡顺;谌丁艳;吴宇;苏喆;谢红卫;...
期刊:
中华流行病学杂志 ,2020年41(5):738-742 ISSN:0254-6450
通讯作者:
Li, Z.
作者机构:
[Hongwei X.] School of Public Health, University of South China, Hengyang, 421000, China;[Fanshun M.; Li Z.; Yu W.; Dingyan C.] Shenzhen City Center for Disease Control and Prevention, Shenzhen, 518000, China;[Zhe S.] Shenzhen Children' S Hospital, Shenzhen, 518000, China
通讯机构:
[Li, Z.] S;Shenzhen City Center for Disease Control and PreventionChina
关键词:
膳食模式;性早熟;学龄儿童
摘要:
目的:探究女童膳食与性早熟的相关性。方法:采用病例对照研究,于2016年9月至2018年12月选取在深圳市某医院确诊为性早熟患儿为病例,进行1∶1的对照匹配,对照来自于深圳市26所小学。采用家长自填问卷的方式进行膳食调查,共调查12种食物的摄入频率,分析膳食模式。采用条件logistic回归分析膳食模式和性早熟的关联。结果:共纳入研究对象568人。其中8岁组年龄人数最多(43.8%);病例组和对照组年龄的中位数相同,均为8.0岁,民族分布相同,差异无统计学意义(
P>0.05)。病例组的身高、体重和BMI的
M分别为135.0 cm、30.2 kg、16.6 kg/m
2,均高于对照组的身高(129.2 cm)、体重(25.0 kg)和BMI(15.3 kg/m
2),差异有统计学意义(
P<0.05)。两组在营养评价方面差异有统计学意义(
P<0.05);共定义了3种膳食模式:平衡、高热量高脂和高蛋白,3种膳食模式的累计方差贡献率为0.541 2;两组膳食模式比较显示平衡、高热量高脂、高蛋白膳食模式在两组间差异均有统计学意义(
χ2=4.41,
χ2=49.24,
χ2=39.68,
P<0.05);多因素回归分析显示平衡膳食模式(
OR=0.633,95%
CI:0.504~0.769)及高蛋白膳食模式(
OR=0.622,95%
CI:0.498~0.776)是性早熟的保护因素,高热量高脂膳食模式是性早熟的危险因素(
OR=1.850,95%
CI:1.461~2.342)。
结论:平衡膳食模式为学龄女童的主要膳食模式,高热量高脂膳食模式是性早熟的危险因素,应教育儿童养成平衡膳食的饮食习惯,同时可提高豆类和鱼类的摄入可有益于正常的生长发育。
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菠萝蛋白酶金纳米簇模拟酶活性比色法检测Hg~(2+)
作者:
刘士蒙;李嘉倩;吕昌银;刘然;李诗雅;...
期刊:
应用化工 ,2020年49(5):1319-1324 ISSN:1671-3206
作者机构:
南华大学 公共卫生学院 衡阳市健康危害因子检验检疫新技术研究重点实验室,湖南 衡阳 421001
关键词:
菠萝蛋白酶;金纳米簇;汞离子;比色传感
摘要:
制备了具有模拟过氧化物酶活性的菠萝蛋白酶-金纳米簇,可催化3,3',5,5'-四甲基联苯胺(TMB)-H_2O_2体系显色。因此,构建了Bromelain-AuNCs-TMB-H_2O_2-Hg~(2+)比色传感平台,并对该体系的催化显色反应机制进行了研究。本方法检测Hg~(2+)的线性范围为6.25 nmol/L ~ 3.5 μmol/L,检出限为4.3 nmol/L。本方法成本低,简便可行,选择性好,为环境水样中的Hg~(2+)检测提供了一种新方法。
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新型杯[4]芳烃衍生物的合成及对U(Ⅵ)吸附性能研究
作者:
张康;许玉历;肖方竹;王成;罗佳琦;...
期刊:
化学工程 ,2020年48(6):16-22 ISSN:1005-9954
通讯作者:
Peng, G.-W.
作者机构:
南华大学资源环境与安全工程学院,湖南衡阳421001;南华大学蛋白质结构与功能实验室,湖南衡阳421001;南华大学化学化工学院,湖南衡阳421001;南华大学公共卫生学院,湖南衡阳421001;[刘永; 彭国文; 陈方; 罗佳琦; 王成; 肖方竹; 张康; 许玉历] 南华大学
通讯机构:
School of Resource Environment and Safety Engineering, University of South China, Hengyang, Hunan Province, China
关键词:
杯[4]芳烃;修饰;等温线;吸附;铀
摘要:
以对叔丁基杯[4]芳烃为原料,用间氨基苯甲酸等化合物对其上沿进行羧基化改性,再利用1,3-二溴丙烷等化合物对其下沿进行功能化修饰,得到一种新型功能化材料间羧基苯偶氮基杯[4]芳烃溴代乙醚衍生物(MCA-BDED),并采用红外光谱、扫描电镜分别对其结构进行表征。考察溶液pH值、吸附时间、铀初始质量浓度、吸附剂投加量等因素对MCA-BDED吸附铀效果的影响,分析吸附过程中的反应动力学和吸附等温线。结果表明:在温度为25 ℃时,MCA-BDED吸附铀的最佳条件是pH值为4.0,铀初始质量浓度为20 mg/L,吸附剂MCA-BDED投加量为20 mg,吸附平衡时间为4 h。MCA-BDED对U(Ⅵ)的吸附过程符合准二级动力学模型,表明吸附过程为化学吸附。Langmuir、Freundlich等温线均可较好地拟合吸附过程,说明该吸附体系是一个单层覆盖与多层吸附相结合的模式。使用3种不同的解析剂对MCA-BDED解吸再生3次后,其对铀的吸附率均在60%以上,说明MCA-BDED对铀有良好的再生性能。
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基于关联网络的空间辐射防护分子靶标的辨识与预测
作者:
谢达菲;关华;樊婵;胡赛;刘晓丹;...
期刊:
科学通报 ,2020年65(5):392-400 ISSN:0023-074X
通讯作者:
Zhang, H.
作者机构:
军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所放射生物学研究室,北京100850;湖南医药学院检验医学院,怀化418000;南华大学公共卫生学院,衡阳421300;中国科学院近代物理研究所,兰州730000
通讯机构:
Institute of Modern Physics, Chinese Academy of Sciences, Lanzhou, China
关键词:
基因表达谱;蛋白质相互作用网络;药物靶标;重离子;模拟退火算法
摘要:
空间辐射对航天员健康的危害制约人类的空间探索活动,对其中重离子成分的医学防护研究是对抗空间辐射人体健康威胁的关键之一.本研究以地面装置模拟空间辐射环境,用0.5和2 Gy剂量的碳离子(~(12)C~(6+))辐照正常人淋巴母细胞AHH-1,照前0.5 h分别用两种已知的辐射防护药物处理细胞,照后4 h用基因表达芯片测量细胞基因表达谱,构建辐射损伤相关基因表达量调节网络.运用基于模拟退火的迭代搜索算法辨识不同剂量~(12)C~(6+)辐照及防护药物作用下的辐射相关基因激活子网,依据节点的连接度预测出PPM1A, RIF1, CASP3, TFE3和RIN1等潜在的空间辐射损伤防护高关联度基因.进一步的富集分析表明,这些基因显著富集的分子功能类别主要与转录调节、激活子活性等有关;细胞定位类别主要是核体、染色体等;生物过程类别主要与信号转导、RNA代谢和细胞定位调节等有关.进一步在Hela细胞上通过Western blotting实验证明, 0.5和2 Gy剂量~(12)C~(6+)辐照后, RIF1基因表达量显著上升,辐照后4 h的相对表达率达到对照组的2倍以上.这种辨识方法通过计算分析理性预测和发掘潜在的辐射损伤防护高关联度人类基因,为重离子辐射损伤医学防护研究提供了新的策略和内容.辨识所得分子靶标为有针对性地进行空间辐射损伤防护药物的研发提供了候选靶标,为细胞响应电离辐射及防护药物作用的分子机制研究提供了线索与支持,对于空间辐射损伤防护技术的提升具有重要的意义.
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功能化间羧基苯偶氮基杯[4]芳烃对称硫醚衍生物的制备及其对U(Ⅵ)的吸附行为研究
作者:
许玉历;张康;肖方竹;王成;罗佳琦;...
期刊:
原子能科学技术 ,2020年54(1):23-30 ISSN:1000-6931
作者机构:
南华大学 化学化工学院,湖南 衡阳 421001;南华大学 资源环境与安全工程学院,湖南 衡阳 421001;南华大学 公共卫生学院,湖南 衡阳 421001;南华大学 湖南省铀尾矿库退役治理工程技术研究中心,湖南 衡阳 421001;[刘永; 彭国文; 罗佳琦; 王成; 肖方竹; 张康; 许玉历] 南华大学
关键词:
杯[4]芳烃;羧基化;吸附;铀
摘要:
采用间氨基苯甲酸为原料,经重氮化-偶联反应对杯[4]芳烃进行上沿改性合成了间羧基苯偶氮基杯[4]芳烃衍生物,再通过取代反应对间羧基苯偶氮基杯[4]芳烃衍生物进行下沿修饰,制备出一种新型材料,即间羧基苯偶氮基杯[4]芳烃对称硫醚衍生物,并采用FT-IR和~1H-NMR对其进行结构表征。将该新型材料作为吸附剂用于吸附低浓度含铀水溶液中的铀,考察了溶液pH值、吸附剂用量、铀初始浓度、吸附时间、吸附体系温度等因素对其吸附性能的影响。结果表明:在铀初始浓度为10 mg/L、pH=4、温度为25℃、吸附剂用量为10 mg、吸附平衡时间为4 h时,间羧基苯偶氮基杯[4]芳烃对称硫醚衍生物对U(Ⅵ)的吸附效果最佳;其吸附过程符合准二级动力学模型,吸附过程为化学吸附;吸附等温线符合Langmuir吸附等温模型,说明该吸附体系是以单层吸附为主。综上所述,间羧基苯偶氮基杯[4]芳烃对称硫醚衍生物是一种潜在的铀吸附剂。
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基于全基因组测序的我国耐多药结核分枝杆菌耐药突变特征分析
作者:
高敏;杨婷婷;李桂莲;陈蓉;刘海灿;...
期刊:
中华流行病学杂志 ,2020年41(5):770-775 ISSN:0254-6450
通讯作者:
Shuidong, F.
作者机构:
[Shuidong F.; Mm G.; Rong C.] School of Public Health, University of South Ghina, Hengyang, 421001, China;[Tingting Y.; Qian G.] School of Basic Medical Sciences, Fudan University, Shanghai, 200032, China;[Kanglin W.; Guilian L.; Haican L.] State Key Laboratory for Infrctioas Diseases Prevention and Control, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing, 102206, China
通讯机构:
[Shuidong, F.] S;School of Public Health, China
关键词:
结核分枝杆菌;耐药;全基因组测序
摘要:
目的:利用全基因组测序数据分析中国耐多药结核分枝杆菌的耐药相关基因突变谱及主要突变类型与菌株基因型的相关性。方法:查询并下载NCBI数据库中截至2019年8月公开发表的中国结核分枝杆菌全基因组测序数据,利用全基因组数据预测菌株分子药敏结果,统计不同药物耐药相关基因的突变类型,并分析耐药突变类型与菌株基因型的相关性。结果:根据分子药敏结果从2 019株菌株中鉴定出1 024株耐多药菌株,对常用抗结核药物的耐药相关基因主要突变类型分别为
katG S315T(73.2%,异烟肼)、
rpoB S450L(63.1%,利福平)、
rpsL K43R(70.0%,链霉素)、
embB M306V(37.4%,乙胺丁醇)、
pncA启动子区T(-11)C(7.9%,吡嗪酰胺)、
gyrA A90V (32.3%,氟喹诺酮类)、
rrs A1401G(67.7%,二线注射类)、
fabG1启动子区C(-15)T(87.0%,乙硫异烟胺)、
folC I43T(30.4%,对氨基水杨酸)。其中,
katG S315T、
rpsL K43R、
embB M306V、
gyrA D94G在L2系菌株中的频率显著高于L4系菌株,
folC I43T仅在L2系菌株中发现;
katG S315T在古典北京型菌株中比例较高,而
rpsL K43R在现代北京基因型菌株中的比例更高,其差异均有统计学意义(均
P<0.05)。
结论:本研究提供了基于全基因组测序的我国耐多药结核分枝杆菌对多种常用抗结核药的耐药相关基因主要突变类型,为研发敏感、特异的快速分子检测方法提供了依据;同时也发现多种耐药相关基因主要突变类型与菌株基因型有关。
语种:
中文
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人体微生物菌群与疾病关系
作者:
陈利;伍海英;陈丽丽
期刊:
生命的化学 ,2020年40(04):555-560 ISSN:1000-1336
作者机构:
南华大学公共卫生学院卫生检验系, 衡阳, 421001;衡阳市健康危害因子检验检疫新技术研究重点实验室, 衡阳市健康危害因子检验检疫新技术研究重点实验室, 衡阳, 421001;南华大学附属第二医院检验科, 衡阳, 421001
关键词:
正常菌群;菌群失调;癌症;代谢性疾病;感染性疾病
摘要:
人体含有大量的正常微生物群,其组成复杂、种类繁多,在机体内发挥各种生理作用,如参与机体代谢、调节免疫等。当受到某些内外源性因素的影响时,微生物群平衡可能会被打破,从而引起微生物群失调,进而引发一系列疾病。越来越多的研究表明,菌群失调与癌症、代谢性疾病及感染性疾病等疾病的发生与发展具有相关性,且恢复微生态平衡对疾病的预防和治疗至关重要。本文就正常微生物菌群与癌症、代谢性疾病及感染性疾病的关系研究进展进行了综述。
语种:
中文
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电离辐射下调miR-34a-5p促进辐射诱导的肺上皮间质转化
作者:
王铎;刘政;刘晓畅;顾永清;周平坤
期刊:
西安交通大学学报(医学版) ,2020年41(3):333-339 ISSN:1671-8259
作者机构:
军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所,北京 100850;南华大学公共卫生学院,湖南衡阳 421001;[刘政; 刘晓畅; 顾永清; 王铎; 周平坤] 中国人民解放军军事科学院
关键词:
上皮间质转化;电离辐射
摘要:
目的探究辐射下调miR-34a-5p在辐射诱导上皮间质转化(EMT)中的作用及其机制。方法Western blotting和流式细胞术检测~(60)Co γ射线照射后肺上皮细胞中EMT相关标志蛋白的表达变化;RT-qPCR检测~(60)Co γ射线照后不同时间点A549细胞和BEAS-2B细胞中miR-34a-5p的表达;将miR-34a-5p过表达或敲低后,Western blotting检测辐射诱导时EMT的表达。生物信息学预测miR-34a-5p的靶基因,RT-qPCR和Western blotting检测miR-34a-5p对靶基因的调控效果。结果6 Gy ~(60)Co γ射线照射后48 h肺上皮细胞发生EMT,RT-qPCR检测显示miR-34a-5p表达下调;过表达miR-34a-5p可逆转辐射诱导的EMT,下调表达miR-34a-5p时,CD44表达升高,并且促进电离辐射诱导的EMT。结论~(60)Co γ射线下调miR-34a-5p促进辐射诱导肺上皮细胞发生EMT,提示miR-34a-5p可能抑制辐射诱导EMT及放射性肺纤维化,有望成为放射性肺纤维化防治的新靶点。
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几种纳米材料在微生物检测中的应用
作者:
刘璐瑶;李美娟;全淑芬;陈丽丽
期刊:
中国病原生物学杂志 ,2020年15(01):123-124,封3 ISSN:1673-5234
作者机构:
南华大学公共卫生学院卫生检验系;衡阳市健康危害因子检验检疫新技术研究重点实验室,湖南衡阳421001;[陈丽丽; 全淑芬; 李美娟; 刘璐瑶] 南华大学
关键词:
纳米材料;微生物;适配体;生物传感器;综述
摘要:
微生物广泛存在于自然界中,与人类健康息息相关,部分微生物侵入或寄生于机体可导致人和动物疾病。分离培养等经典的微生物检测方法具有耗时长、操作复杂、仪器设备要求高等缺点,故需要开发新的简便易行的微生物检测方法。纳米材料是指在三维空间中至少一维尺度小于100 nm的材料,利用其光学、磁学、电化学等特殊性质,结合荧光法、比色法或电化学等方法,直接或间接检测微生物的特异性蛋白质、DNA或RNA,可更快速、准确地定性或定量检测微生物。本文以几种纳米材料在微生物检测中的应用进展进行了综述。
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NLRP3炎性小体抑制剂MCC950对辐射所致认知障碍的保护作用
作者:
刘政海;罗诗诗;王贞;徐杨;何洁;...
期刊:
中华放射医学与防护杂志 ,2020年40(10):733-739 ISSN:0254-5098
通讯作者:
Cao, W.
作者机构:
[刘政海; 李彩; 王五洲; 曹文宇; 罗诗诗] Clinical Anatomy & Reproductive Medicine Application Institute, Medical College, University of South China, Hengyang, 421001, China;[徐杨] Department of Physiology, Medical College, University of South China, Hengyang, 421001, China;[何洁] Department of Pathology, Medical College, University of South China, Hengyang, 421001, China;[Wang W.; 何淑雅] School of Public Health, University of South China, Hengyang, 421001, China;[艾小红] Department of Radiation Oncology, The First Affiliated Hospital of University of South China, Hengyang, 421001, China
通讯机构:
[Cao, W.] C;Clinical Anatomy & Reproductive Medicine Application Institute, Medical College, University of South China, Hengyang, China
关键词:
辐射;认知损伤;NLRP3炎性小体;小鼠
摘要:
目的:探讨MCC950对辐射所致小鼠认知障碍的影响及可能机制。方法:小鼠按随机数表法分为健康对照(NS)组、全身照射(IR)组和照射后MCC950干预(IR+MCC950)组,每组15只。IR组和IR+MCC950组小鼠给予
137Cs单次4.0 Gy照射,吸收剂量率为1.118 Gy/min,NS组不接受照射。IR+MCC950组小鼠从照射后3周开始腹腔注射MCC950,每日1次,每次10 mg/kg。新旧事物识别等方法检测小鼠认知功能;免疫组织化学法检测小鼠海马CA3区NeuN蛋白的表达;PCR及Western blot检测NLRP3炎性小体相关蛋白的表达。
结果:与NS组相比,IR组小鼠短时及长期新旧事物识别指数显著降低(
t=4.321、5.473,
P<0.01),IR组小鼠社会认知识别指数显著降低(
t=2.097,
P<0.05)。MCC950治疗逆转以上改变(短时及长期新旧事物识别测验:
t=5.860、4.598,
P<0.05;新旧位置识别测验:
t=3.040,
P<0.05;社会认知测验:
t=4.021,
P<0.01)。IR组小鼠海马NLRP3、Caspase-1、IL-1β和IL-18的表达明显高于NS组(
t=2.699、8.515、3.340、3.950,
P<0.05);与NS组相比,辐射显著上调了海马BAX、Caspase-3和PARP1的表达(
t=3.887、2.742、3.287,
P<0.05),而MCC950显著降低了其表达(
t=2.852、4.090、9.614,
P<0.05)。
结论:NLRP3炎性小体抑制剂MCC950可能是通过降低辐射所致的海马炎症反应及神经元凋亡,从而减轻辐射所致认知损伤。
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α粒子辐射诱发人支气管上皮BEP2D细胞癌变的snoRNA鉴定及靶标预测
作者:
岳小乔;白琛俊;谢达菲;刘晓丹;周平坤
期刊:
中华放射医学与防护杂志 ,2020年40(6):413-419 ISSN:0254-5098
通讯作者:
Zhou, P.
作者机构:
[周平坤; 岳小乔] The School of Public Health, University of South China, Hengyang, 421001, China;[谢达菲; 白琛俊; 刘晓丹] The Institute of Radiation Medicine, The Academy of Military Medical Science, Beijing, 100850, China
通讯机构:
[Zhou, P.] T;The School of Public Health, University of South China, Hengyang, China
关键词:
α粒子;电离辐射;癌变
摘要:
目的:识别鉴定α粒子辐射致人支气管上皮BEP2D细胞癌变中的差异表达核仁小分子RNA(snoRNA),预测其靶标基因及RNA共表达网络。方法:通过全基因组转录组微阵列芯片对人支气管上皮细胞BEP2D及由其衍生的α粒子诱发癌变的BERP35T-4细胞的RNA差异表达谱分析,从中筛选出差异表达的snoRNA,qRT-PCR验证包括其衍生sdRNA在内的表达变化,通过生物信息学分析snoRNA的功能区,预测靶标和共表达网络。结果:qRT-PCR验证结果与芯片结果一致,sno116家族在BERP35T-4中表达下降,是BEP2D的0.105%,差异有统计学意义(
t=26.60,
P<0.01);筛选的sno116-14等在癌变细胞BERP35T-4及人肺癌细胞A549和H1299等中表达量普遍下调,并且还发现sno116-14衍生的sdRNA的表达量在同一细胞中差异显著,建立了sno116家族的mRNA-lncRNA共表达网络,预测靶标有ZNF280D、TFDP1、CCDC28B、RPS6KA3、CANX、RUNX1、KALRN等,功能上与细胞增殖、细胞骨架结构等相关。
结论:识别鉴定了α粒子辐射致细胞癌变相关差异表达snoRNA,预测sno116-14的靶标基因参与细胞增殖、细胞骨架结构等生物学过程和功能调控信号通路,为C/D box snoRNA发挥功能的作用方式及电离辐射致癌机制提供了新的信息。
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